Vignette d'image

Bellah, Hadjer

Nom
Bellah, Hadjer
Affiliation principale
Fonction
Ancien.ne collaborateur.trice
Identifiants
https://libra.unine.ch/handle/123456789/30790

Résultat de la recherche

Filtres

1
1
1
1
1
Réinitialiser les filtres

Paramètres

Voici les éléments 1 - 1 sur 1
  • Publication
    Accès libre
    Tracking evolutionary dynamics within the fungal wheat pathogen "Zymoseptoria tritici"
    (2023)
    Bellah, Hadjer 
    ;
    Croll, Daniel 
    Français Les champignons pathogènes sont de nature très diverse et peuvent poser de graves risques par le biais d'infections simples ou mixtes à la production alimentaire mondiale. Le contrôle des cultures est basé sur l'utilisation de produits chimiques synthétiques ainsi que la sélection de plantes résistantes. Cependant, les pathogènes fongiques des plantes surmontent rapidement les deux stratégies. Lors de co-infections, les phytopathogènes peuvent augmenter la sévérité de la maladie et modifier l'évolution de la virulence des génotypes co-infectants. Par conséquent, les outils de surveillance permettant une meilleure détection des agents pathogènes des cultures ainsi que la compréhension de l'impact des événements de co-infection sur la gravité de la maladie ne sont pas toujours efficace. De plus, nous manquons encore d'informations sur la base génétique responsable de l'évolution de la virulence et de la résistance aux fongicides au fil du temps. Dans cette thèse de doctorat, J’ai concentrés sur le développement d'un outil de surveillance pour tracer l'évolution de la virulence et de la résistance aux fongicides chez le pathogène fongique du blé Zymoseptoria tritici à l'aide de différents outils moléculaires et génomiques. Ici, j’ai développé un outils de génotypage pour multiplexer plusieurs locus ciblant les gènes de virulence et de résistance aux fongicides, et des marqueurs sélectionnés au hasard à l'échelle du génome. Plus d'une centaine de types d'échantillons ont été utilisés pour évaluer la bonne performances de mon outil. Cela a ensuite permis une amplification précise de tous les locus conçus et a bien fonctionné quel que soit le type d'échantillon. J’ai également exploré les conséquences d'interactions mixtes à l'intérieur et à l'extérieur de la plante hôte en utilisant un échantillon de grande taille pour fournir une image plus approfondie des conséquences de ces interactions sur la gravité de la maladie de plante ainsi que sur le changement de virulence et de croissance. J’ai constaté que la cinétique de croissance et la virulence dans les interactions simples s'écartaient de celles observées lors des interactions mixtes, indiquant une preuve d'exclusion compétitive entre les souches conspécifiques. De plus, les résultats étaient divergents à l'intérieur et à l'extérieur de la plante hôte, ce qui indique que le système immunitaire de la plante pourrait jouer un rôle clé dans la modulation des conséquences de l'interaction mixte à l'intérieur de la plante et ajoute une complexité significative. Enfin, j'ai utilisé un grand jeux de donnée de la population mondiale de Z.tritici pour étudier les éléments transposables situés à proximité d'importants locus de gènes de virulence et de résistance aux fongicides permettant de comprendre l'histoire évolutive du pathogène dans le monde ainsi que d’établir de meilleures stratégies de protection de cultures. J’ai identifié un nombre considérable d'éléments transposables appartenant à différentes familles et superfamilles. J’ai également détecté des insertions récentes représentées par des insertions uniques. Dans l'ensemble, cette thèse de doctorat permet le traçage des génotypes de Z.tritici nouvellement évolués et de comprendre la base génétique médiant leur évolution. En outre, fournir des informations sur les conséquences des interactions mixtes sur la gravité de la maladie et sur la manière dont elles peuvent façonner le changement de virulence et la capacité de croissance des champignons phytopathogènes.