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Comparative phylogeography of wild wheat and their inhabiting transposable elements

Titre du projet
Comparative phylogeography of wild wheat and their inhabiting transposable elements
Description
Les éléments transposables (ETs) peuvent se multiplier et changer de position dans les chromosomes, avec comme conséquences la possibilité de modifications dans la structure et la fonction du génome. Les ETs représentent une fraction importante du matériel génétique qui atteint 80% chez le blé. Cependant, les conséquences respectives des ETs, du génome hôte et de leurs interactions sur l’évolution des espèces sont méconnues. En outre, peu de données existent sur la variation géographique des ETs au sein d’espèces proches. Notre projet concerne des cousines du blé, les égilopes (Aegilops sp). Nous déterminerons dans quelle mesure les génomes et les ETs ont évolués indépendamment. Pour cela, nous allons comparer les évolutions respectives du génome et des ETs dans l’espace et dans le temps. Nous allons aussi comparer des populations du centre de diversification de ces espèces (Est Méditerranée) avec celles qui poussent à la marge de leurs distributions (Ouest Méditerranée).
Chercheur principal
Felber, François
Parisod, Christian 
Statut
Completed
Date de début
1 Juillet 2014
Date de fin
30 Juin 2017
Organisations
Institut de biologie 
Identifiant interne
32501
identifiant
https://libra.unine.ch/handle/123456789/1879
Mots-clés
  • Aegilops
  • phylogeography
  • genome dynamics
  • wheat
  • phylogeny
  • hybrid zone
  • next generation sequencing
  • transposable elements
  • Aegilops

  • phylogeography

  • genome dynamics

  • wheat

  • phylogeny

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