Dimitry Queloz montre l'important développement de l'Etat-major général (EMG) au cours de la période 1874-1906, qui a par ailleurs vu sa position institutionnelle se renforcer parmi les autres acteurs de l'administration militaire suisse. La Loi sur l'organisation militaire de 1907 a ainsi consacré l'ensemble de ce développement et l'EMG est devenu le premier des services du Département militaire fédéral (DMF). En dépit de cette meilleure assise institutionnelle, l'EMG et ses chefs ont été la cible de vives critiques. Ils ont notamment été touchés, en 1903, par l'affaire de l'hydre, une sombre histoire mêlant querelles personnelles et divergences de conception de l'armée. Après avoir coûté leur place à quelques hauts personnages du DMF, elle a conduit à la démission du chef de l'EMG, Arnold Keller. Celui-ci a été vivement, mais injustement, critiqué dans la gestion de son institution et, surtout, la préparation de l'armée à la guerre.