Génomique vigne séquençage du génome GWAS études d'associations pan-génomiques
Description
De nombreuses actions ont été financées dans le cadre de la conservation de la biodiversité du matériel Vitis issu de la collection nationale d'Agroscope à Pully et des collections d'introduction suite aux prospections réalisées en Suisse. Ce matériel dûment décrit est enregistré dans la base de données BDN. L'identification à l'aide des caractéristiques macroscopiques utilisant les descripteurs ampélographiques a été complétée par l'identification moléculaire à l'aide de marqueurs microsatellites. La méthode du séquençage haut débit est proposée dans ce projet pour permettre le séquençage complet des accessions de la liste positive et de biotypes de chasselas. Cette approche novatrice permettra d'identifier la base génétique de traits phénotypiques différenciant des biotypes, de caractériser les liens de parenté entre accessions et d'identifier d'éventuels gènes de résistance aux maladies. La technologie pan-génomiqe assurera que les données générées seront utiles à très long terme.