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Comparative phylogeography of wild wheat and their inhabiting transposable elements
Responsable du projet François Felber
   
Collaborateur Christian Parisod
   
Résumé Les éléments transposables (ETs) peuvent se multiplier et changer de position dans les chromosomes, avec comme conséquences la possibilité de modifications dans la structure et la fonction du génome. Les ETs représentent une fraction importante du matériel génétique qui atteint 80% chez le blé. Cependant, les conséquences respectives des ETs, du génome hôte et de leurs interactions sur l’évolution des espèces sont méconnues. En outre, peu de données existent sur la variation géographique des ETs au sein d’espèces proches. Notre projet concerne des cousines du blé, les égilopes (Aegilops sp). Nous déterminerons dans quelle mesure les génomes et les ETs ont évolués indépendamment. Pour cela, nous allons comparer les évolutions respectives du génome et des ETs dans l’espace et dans le temps. Nous allons aussi comparer des populations du centre de diversification de ces espèces (Est Méditerranée) avec celles qui poussent à la marge de leurs distributions (Ouest Méditerranée).
   
Mots-clés Aegilops, phylogeography, genome dynamics, wheat, phylogeny, hybrid zone, next generation sequencing, transposable elements
   
Type de projet Recherche fondamentale
Domaine de recherche Botanique
Source de financement FNS - Encouragement de projets (Div. I-III)
Etat Terminé
Début de projet 1-7-2014
Fin du projet 30-6-2017
Budget alloué 357'335.00
Contact François Felber