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Caractérisation génétique pan-génomique des accessions de la vigne en Suisse
Project responsable Daniel Croll
   
Abstract De nombreuses actions ont été financées dans le cadre de la conservation de la biodiversité du matériel Vitis issu de la collection nationale d'Agroscope à Pully et des collections d'introduction suite aux prospections réalisées en Suisse. Ce matériel dûment décrit est enregistré dans la base de données BDN. L'identification à l'aide des caractéristiques macroscopiques utilisant les descripteurs ampélographiques a été complétée par l'identification moléculaire à l'aide de marqueurs microsatellites. La méthode du séquençage haut débit est proposée dans ce projet pour permettre le séquençage complet des accessions de la liste positive et de biotypes de chasselas. Cette approche novatrice permettra d'identifier la base génétique de traits phénotypiques différenciant des biotypes, de caractériser les liens de parenté entre accessions et d'identifier d'éventuels gènes de résistance aux maladies. La technologie pan-génomiqe assurera que les données générées seront utiles à très long terme.
   
Keywords Génomique; vigne; séquençage du génome; GWAS; études d'associations pan-génomiques
   
Type of project Applied research project
Research area Génomique
Method of financing Office fédéral de l'agriculture
Status Ongoing
Start of project 1-1-2018
End of project 31-12-2020
Overall budget 90'345 CHF
Contact Daniel Croll